Após o primeiro microssegundo, com as temperaturas em queda, as partículas não se moviam mais tão rapidamente e podiam se aglutinar. As primeiras a fazê-lo foram os quarks - partículas pesadas que compõem os prótons e os nêutrons no núcleo de todos os atómos atuais. Uma pequena proporção deles ligou-se então para formar os núcleos dos elementos leves. Os fótons saltavam de um lado para outro entre particulas de matéria, impedindo-as de fundir, e o cosmo era opaco. Matéria escura, não afetada pelos fótons, começou a formar estrutura. Por fim, após 300 mil anos, núcleo e elétrons combinaram-se em átomos. O número de particulas caiu rapidamente e a bruma do universo dissipou-se.